针对您提出的“公司罚款员工两次离职怎么处理”的问题，这实际上涉及到了公司对员工同一违纪行为的重复处罚问题，以及这种处罚是否合法合规的考量。

首先，我们需要明确的是，根据劳动法的相关规定和“一事不二罚”的法治原则，公司对员工的同一违纪行为，在已经给予相应处罚（如扣减工资）后，不得再次以同一事由进行更严厉的处罚（如解除劳动合同）。这是因为，重复处罚不仅违反了公平公正的原则，也可能损害员工的合法权益，导致劳动关系的不稳定。

接下来，我们结合一个具体案例来进一步说明这个问题。某公司员工张某，就曾遭遇过类似的“双重处罚”。张某在2022年因不按时参加部门会议、值岗期间脱岗等行为，被公司扣减了工资。然而，在时隔近一年后，公司又以张某2022年的这些行为为由，解除了与他的劳动合同。张某对此提出异议，认为公司属于重复处罚，并一路从仲裁诉至法院。最终，法院认定公司的解除行为违法，需向张某支付违法解除劳动合同赔偿金。

这个案例清晰地告诉我们，公司对员工的违纪行为应及时处理，并在合理期限内行使解除权。如果公司怠于行使解除权，而选择与员工继续履行原劳动合同，那么这将被视为公司对员工违规行为的容忍。此后，公司再以同一事由解除劳动合同，就明显不具有合理性，也违反了“一事不二罚”的原则。

那么，针对您提出的问题，如果公司已经对员工进行了罚款（扣减工资）等处罚，并且员工在后续的工作中并未再出现任何违反规章制度的行为，那么公司就不得再次以同一事由对员工进行更严厉的处罚（如解除劳动合同）。如果公司这样做了，员工有权通过法律途径维护自己的合法权益，包括申请劳动仲裁或提起诉讼等。

最后，我想强调的是，构建和谐稳定的劳动关系需要公司和员工双方的共同努力。公司应该遵循及时性、合理性和“一事不二罚”的法治原则来管理员工，而员工也应该遵守公司的规章制度，共同维护一个公平、公正、和谐的工作环境。