在民事诉讼中，如果对方不予配合会计审计，这确实会给案件的审理带来一定的困扰。不过，法律为我们提供了一系列应对此类情况的措施。以下是一些详细的建议：

一、向法院提请强制令

首先，您可以向法院提请强制令，要求对方协助诉讼进程，特别是提交与会计审计相关的证据。如果对方仍然不配合，法院会根据具体情况采取相应的司法处罚措施，如罚款或拘留。这是法律赋予您的一种重要权利，可以有效促使对方履行其诉讼义务。

二、申请调查令

如果对方拒绝提供必要的会计审计资料，您还可以向法院申请调查令。调查令允许法院指定相关单位（如会计师事务所、银行等）协助取证，从而确保诉讼的顺利进行。这种方式可以绕过对方的不配合，直接获取关键证据。

三、及时与法官沟通

在诉讼过程中，及时与承办案件的法官沟通至关重要。您可以将对方不配合的情况详细告知法官，并请求法官督促对方配合。法官作为中立的第三方，有权要求对方履行诉讼义务，并在必要时采取相应的法律措施。

四、留存对方不配合的证据

为了维护自身的诉讼权益，您还需要留存好对方不配合的相关证据。这些证据可以包括书面通知、录音、视频等。在后续的诉讼过程中，这些证据将起到至关重要的作用，有助于您证明对方的不配合行为，并争取到更有利的判决结果。

五、法律对不配合行为的制裁

如果对方在诉讼中持续不配合，法律也规定了相应的制裁措施。例如：

• 妨害证据收集：如果对方拒绝提供证据或伪造、毁灭重要证据，法院可以根据情节轻重对其予以罚款、拘留；构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。
• 无正当理由拒不到庭：对于必须到庭的被告，如果经两次传票传唤无正当理由拒不到庭，法院可以拘传；对于非必须到庭的被告，法院可以缺席判决。
• 违反法庭规则：如果对方在法庭上哄闹、冲击法庭等，法院可以予以训诫、责令退出法庭或予以罚款、拘留；严重扰乱法庭秩序的，还将依法追究刑事责任。

六、其他应对措施

除了上述措施外，您还可以考虑以下应对策略：

• 通过合法途径收集其他证据：如果对方不配合提供会计审计资料，您可以尝试通过其他合法途径收集能证明案件事实的其他证据。
• 申请强制执行：如果最终您获得了胜诉判决，但对方仍然不履行生效判决，您可以在规定时间内向法院申请强制执行。法院有权查询、冻结、划拨被申请执行人的存款，查封、扣押、拍卖、变卖被申请执行人的财产等。

总之，面对对方不予配合会计审计的情况，您需要保持冷静并积极采取应对措施。通过向法院提请强制令、申请调查令、及时与法官沟通、留存证据以及利用法律对不配合行为的制裁措施等方式，您可以有效维护自身的诉讼权益并争取到更有利的判决结果。