在婚生子女情况下，若父亲要求做亲子鉴定而母亲拒绝，法院的判决会依据具体情况和法律规定来作出。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、明确结论与法律依据
若父亲有充分证据且母亲无正当理由拒绝：
- 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释（一）》第三十九条，若父亲提供了必要证据证明亲子关系存在争议，而母亲没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，人民法院可以认定父亲确认亲子关系的主张成立。这意味着，在证据充分且母亲无正当理由拒绝的情况下，法院可能会推定亲子关系存在，并据此作出判决。
若母亲有合理理由拒绝或父亲证据不足：
- 如果母亲有合理的理由拒绝进行亲子鉴定，比如担心鉴定过程对孩子造成心理伤害，或者父亲提供的证据不足以证明亲子关系存在争议，那么法院可能不会直接推定亲子关系。在这种情况下，法院可能会要求双方进一步提供证据，或者通过其他方式来查明事实。
二、法律途径与解决方案
协商与调解：
- 在诉讼之前，双方可以尝试通过协商或调解来解决争议。这可以包括家庭内部的沟通、寻求亲友或专业人士的帮助等。通过协商或调解，双方可能能够达成一致意见，从而避免诉讼。
提起诉讼：
- 如果协商或调解无果，父亲可以向人民法院提起诉讼，请求确认亲子关系。在诉讼过程中，父亲需要提供充分证据来证明自己的主张，而母亲则有权进行反驳并提供相反证据。
举证责任与证据规则：
- 在诉讼中，举证责任是关键。父亲需要提供必要证据来证明亲子关系存在争议，比如出生证明上的父亲信息与实际不符、双方没有血缘关系的医学证明等。而母亲则需要提供相反证据来反驳父亲的主张，或者说明自己拒绝鉴定的合理理由。
三、可能的法律后果
若法院认定亲子关系存在：
- 父亲需要承担抚养义务，包括支付抚养费、教育费等。同时，这也将影响孩子的身份认同和家庭关系。
若法院认定亲子关系不存在：
- 父亲则不需要承担抚养义务。但这也可能对孩子的心理和家庭关系造成负面影响。
四、建议与注意事项
- 保护孩子权益：在整个过程中，应优先考虑孩子的权益和感受。避免将孩子卷入争议中，尽量减少对孩子的心理伤害。
- 提供充分证据：无论是父亲还是母亲，在诉讼过程中都应提供充分证据来支持自己的主张。这有助于法院查明事实并作出公正判决。
- 寻求专业帮助：如果双方对法律程序或证据规则不熟悉，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，确保双方的权益得到妥善保护。
综上所述，法院在判决婚生子女亲子鉴定争议时，会依据具体情况和法律规定来作出。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。