防水工程不合格，通常由市场监督管理部门进行行政处罚。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、行政处罚的法律依据与部门职责
根据《中华人民共和国产品质量法》等相关法律法规，市场监督管理部门负责产品质量监督管理工作，包括对防水工程等建筑材料的质量进行监督抽查。当发现防水工程不合格时，市场监督管理部门有权依据相关法律法规对责任方进行行政处罚。
二、行政处罚的具体情形与流程
监督抽查与检验：
- 市场监督管理部门会定期或不定期地对市场上的防水工程等建筑材料进行质量监督抽查。
- 抽查过程中，会对防水工程的各项性能指标进行检验，如热老化（尺寸变化率）项目、浸水后质量增加项目等。
不合格判定与处罚决定：
- 如果检验结果不符合相关国家标准或行业标准，市场监督管理部门会判定该防水工程为不合格。
- 随后，市场监督管理部门会依据《中华人民共和国产品质量法》等相关法律法规，对责任方（如生产商、销售商或施工单位）作出行政处罚决定，包括责令停止生产销售、罚款等。
处罚执行与后续监督：
- 责任方在收到行政处罚决定后，应立即停止生产销售不合格产品，并按照要求进行整改。
- 市场监督管理部门会对责任方的整改情况进行后续监督，确保不合格产品不再流入市场。
三、相关案例与启示
以辽宁省市场监督管理局发布的典型案例为例，辽宁辰泰防水科技发展有限公司因生产不符合国家标准防水卷材而受到行政处罚。这一案例表明，市场监督管理部门在防水工程质量监督方面发挥着重要作用，对不合格产品会依法进行严厉打击。
四、法律建议与风险提示
对于生产商和销售商：
- 应严格遵守相关法律法规和标准要求，确保生产的防水工程等建筑材料质量合格。
- 在产品出厂前，应进行严格的质量检验，避免不合格产品流入市场。
对于施工单位：
- 在选择防水工程材料时，应选择质量可靠、符合标准的产品。
- 在施工过程中，应严格按照施工规范进行操作，确保防水工程质量。
风险提示：
- 如果防水工程不合格，不仅可能面临市场监督管理部门的行政处罚，还可能因质量问题引发纠纷或诉讼，给责任方带来经济损失和声誉损害。
如有关于防水工程不合格行政处罚或其他法律问题的疑问，可以直接向我咨询。我将运用我的专业知识和经验，为您提供全面、准确的法律解答。