休年假已调休，用人单位要扣工资是不合法且不合理的，职工在年休假期间应享受与正常工作期间相同的工资收入。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

法律法规明确带薪年休假制度

根据《中华人民共和国劳动法》第四十五条及《职工带薪年休假条例》第二条，国家实行带薪年休假制度。职工连续工作一年以上的，享受带薪年休假。这是职工的法定权利，单位应当保证职工享受这一权益。因此，休年假是职工的合法权益，用人单位不得无故剥夺或克扣工资。

年休假期间的工资待遇

职工在年休假期间应享受与正常工作期间相同的工资收入。这意味着，休年假时，职工的工资应照常发放，不得扣减。如果用人单位扣发职工休年假期间的工资，这种行为违反了劳动法律法规的规定，属于违法行为。

用人单位的违法责任

如果用人单位扣发职工休年假期间的工资，职工有权采取多种措施维护自身权益。具体包括：

1. 与用人单位协商：首先尝试与单位沟通，说明法律规定，要求其补发被扣工资。
2. 向劳动监察部门投诉：若协商不成，可向当地劳动监察大队投诉。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行查处，责令其限期支付相应工资。
3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果用人单位仍然拒不支付，职工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼，通过法律程序要求用人单位支付年假工资以及可能的赔偿金。

特殊情况的处理

• 如果职工在年休假期间自愿放弃休假并提供了正常劳动，用人单位应当按照正常工资标准支付其工资，不能因未休年休假而减少工资。
• 若用人单位安排了职工休年休假，但职工因工作需要未能休假，用人单位需按照《职工带薪年休假条例》的规定，支付其未休年休假的工资报酬。

总结与建议

休年假是职工的合法权益，用人单位不得扣发职工在年休假期间的工资。如遇此类情况，职工应依法维权，确保自己的合法权益得到保障。同时，用人单位也应遵守相关法律法规，确保职工的带薪年休假权益得以实现。如果职工在休年假过程中遇到任何问题，可以直接向我咨询，我将提供专业的法律帮助。