医疗器械生产企业管代在子母公司任职是否算兼职，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 若管代在子母公司间存在劳动关系重叠

• 若管代同时与母公司和子公司签订劳动合同，且两家公司均支付工资、缴纳社保，则通常构成法律意义上的“兼职”。根据《劳动合同法》及相关规定，劳动者在同一时期内一般只能与一家用人单位建立全日制劳动关系。若管代在两家公司均承担全职工作，可能涉及违反劳动合同约定或公司规章制度，甚至可能引发劳动纠纷。
• 法律后果：若管代未如实告知兼职情况，可能面临被解雇的风险，且可能无法获得经济补偿。此外，若因兼职行为导致工作失误或给公司造成损失，管代可能需承担赔偿责任。

2. 若管代在子母公司间仅存在管理职责重叠

• 若管代仅作为母公司管理人员，同时对子公司进行管理，但未与子公司建立劳动关系（如未签订劳动合同、未领取子公司工资），则通常不构成法律意义上的“兼职”。这种情况下，管代的行为更多属于母公司对子公司的管理延伸，是公司内部治理结构的体现。
• 法律合规性：需确保管代的行为符合公司章程、内部管理制度以及相关法律法规的规定。例如，管代在子公司行使管理权时，应确保不违反子公司独立法人地位的原则，不损害子公司及其他股东的利益。

3. 特殊情形：关联公司间的职务兼任

• 若子母公司属于关联公司，且管代在两家公司间的职务兼任经过合法程序批准（如董事会决议、股东会同意等），且未违反法律法规的强制性规定，则可能被视为合法行为。这种情况下，管代的兼任行为需符合公司治理结构的要求，确保决策的透明度和公正性。
• 合规建议：即使关联公司间的职务兼任被允许，也应签订明确的协议，规定管代的职责、权限、薪酬分配等事项，以避免后续纠纷。

4. 实务建议

• 明确劳动关系：管代应明确自己与子母公司间的劳动关系，避免同时与两家公司建立全日制劳动关系。
• 完善内部管理：子母公司应完善内部管理制度，明确管代的职责和权限，避免因管理重叠导致的工作混乱或法律风险。
• 合规审查：在管代兼任前，应进行合规审查，确保兼任行为符合法律法规和公司章程的规定。

总结：医疗器械生产企业管代在子母公司任职是否算兼职，需根据其与子母公司间的劳动关系、管理职责以及公司治理结构等因素综合判断。如有具体案例或疑问，可直接向我咨询，我将结合实际情况提供专业法律意见。