农民工工资确认书盖章后，在符合法律规定和合同约定的情形下是有效的。具体分析如下：

1. 盖章的效力
   根据《民法典》及相关司法解释，合同或确认文件经双方签字、盖章后成立并生效（除非法律另有规定或当事人另有约定）。农民工工资确认书若由用人单位（或承包方）盖章、农民工签字，通常视为双方对工资数额、支付时间等核心条款达成合意，具有法律效力。
   例外情形：若盖章单位无合法资质（如未注册的包工头私刻公章），或盖章行为存在欺诈、胁迫等情形，可能影响效力。

2. 需满足的条件

   • 主体合法：盖章方应为具有用工主体资格的单位（如建筑公司、劳务公司），而非个人包工头（个人包工头签字可能因主体不适格导致确认书无效）。
     
   • 内容明确：确认书需载明工资标准、工作时间、支付方式等关键信息，避免模糊表述。
     
   • 程序合规：双方应在平等、自愿的基础上签署，避免用人单位单方面制作文件强迫农民工签字。

3. 实务建议

   • 农民工：签署前仔细核对工资数额、支付时间，要求用人单位加盖公章或合同专用章，并保留一份原件。
     
   • 用人单位：确保确认书内容真实，避免通过虚假确认逃避支付义务，否则可能面临行政处罚或刑事责任（如拒不支付劳动报酬罪）。

若遇到盖章后用人单位拒不支付工资的情况，农民工可凭确认书向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁、提起诉讼，要求支付工资及赔偿金。如有具体案例或条款疑问，可直接向我咨询。