在名为借款但实际是履约保证金的情况下，起诉时的案由通常应确定为与合同相关的纠纷，具体可能涉及合同纠纷或特定类型的合同纠纷（如建设工程施工合同纠纷中的履约保证金纠纷，若该保证金与建设工程施工合同相关）。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、案由确定的基本原则
在民事诉讼中，案由的确定通常基于当事人之间争议的法律关系性质。当名为借款实为履约保证金时，双方之间的真实法律关系并非借贷关系，而是基于某种合同（如买卖合同、建设工程施工合同等）产生的履约保证金关系。因此，起诉时的案由应反映这种真实的法律关系。
二、具体案由的确定
合同纠纷：
- 如果履约保证金是基于一般合同（如买卖合同、服务合同等）产生的，那么起诉时的案由可以确定为“合同纠纷”。
- 在此类纠纷中，原告需要证明双方之间存在合同关系，且被告未按照合同约定履行义务（如未退还履约保证金），从而要求被告承担相应的违约责任。
特定类型的合同纠纷：
- 如果履约保证金是与特定类型的合同（如建设工程施工合同）相关的，那么起诉时的案由可以更具体地确定为“建设工程施工合同纠纷”中的履约保证金纠纷部分。
- 在此类纠纷中，除了需要证明合同关系和违约事实外，还可能需要考虑建设工程施工合同的特殊性，如工程进度、质量标准等。
三、案由确定的注意事项
- 避免误导：在起诉时，应准确描述双方之间的真实法律关系，避免将案由确定为与实际不符的“民间借贷纠纷”。因为如果案由确定错误，可能会导致法院在审理过程中偏离真实的法律关系，从而影响判决结果。
- 证据准备：无论选择哪种案由，原告都需要准备充分的证据来证明自己的主张。这包括合同文本、履约保证金的支付凭证、被告未履行义务的证据等。
- 法律适用：在确定案由后，还需要考虑适用的法律法规。不同的案由可能涉及不同的法律条款和司法解释，因此需要仔细研究相关法律法规，以确保自己的主张有法律依据。
四、实际操作建议
- 咨询专业律师：虽然我在这里提供了基本的分析，但每个案件的具体情况都可能有所不同。因此，在实际操作中，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。
- 仔细审查合同：在起诉前，应仔细审查与履约保证金相关的合同条款，以确保自己的主张与合同约定相符。
- 准备充分证据：如前所述，证据是诉讼的关键。因此，在起诉前应尽可能收集并整理好相关证据。
最后，如果您在此类案件中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。