事业单位在职人员经营企业是否违法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下是从不同角度进行的详细分析：
一、一般情况下的合法性
对于普通事业单位人员而言，如果所在单位没有相关禁止性规定，并且不违反《事业单位工作人员处分暂行规定》中关于“违反国家规定，从事、参与营利性活动或者兼任职务领取报酬”的条款，同时确保不影响本职工作的正常履行，那么经营企业是合法的。例如，一名普通的文化馆工作人员，在业余时间注册一家与本职工作关联度不高的文化创意类公司，且并未干扰其在文化馆的工作，这种情况通常是被允许的。
二、特殊情况下的违法性
限制类岗位：
- 某些特殊事业单位，特别是那些与公共利益、监管职责紧密相关的岗位，如卫生监督所、食品药品监管部门等，其工作人员可能受到更严格的限制。这些单位的关键岗位工作人员往往被明确禁止从事经营性活动，以防止利益冲突和保证公正执法。若此类人员擅自经营企业，将构成违法违规。
竞业限制约定：
- 若事业单位与工作人员签订的聘用合同中包含了竞业限制条款，明确规定了员工在一定期限内不得从事与本单位业务有竞争关系的经营活动，那么在此期间内经营企业将属于违约行为，甚至可能触犯法律。例如，某科研事业单位与技术骨干签订了竞业限制协议，规定离职后两年内不得在同领域自行创业或到竞争企业工作，若该骨干违反此约定开办竞争性质的公司，则将面临法律责任。
法律法规的特殊规定：
- 对于党员事业单位人员，《中国共产党纪律处分条例》有更为严格的约束。党员干部违反规定从事营利活动，如经商办企业等，将视情节轻重给予相应的党纪处分。
- 部分参照公务员法管理的事业单位，其人员经商可能受到类似公务员法的限制。例如，原系领导成员或担任一定层级以上职务的人员，在离职后的一段时间内，可能不得从事与原工作业务直接相关的营利性活动。
三、违法后果
若事业单位人员违反相关规定经营企业，可能会面临一系列严重的法律后果，包括但不限于受到处分（如警告、记过、降低岗位等级或撤职、开除等）、罚款，甚至可能被追究刑事责任。
四、建议与提醒
为避免不必要的法律风险，事业单位人员在考虑经营企业时，应首先：
- 咨询所在单位：了解单位是否有相关禁止性规定或特殊要求。
- 审查聘用合同：查看合同中是否包含竞业限制条款或其他限制性规定。
- 评估影响：谨慎评估经营企业对本职工作的影响，以及是否存在利用单位资源或影响力的风险。
- 寻求法律意见：在决定经营企业前，寻求专业律师的法律意见，以确保合法合规。
总之，事业单位在职人员经营企业是否违法，需根据具体情况判断。在做出决策前，务必详细了解并遵守相关法律法规和单位规定，以确保自己的行为合法合规。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。