对于宅基地违法行为的立案查处，主要的执法主体是县级以上人民政府农业农村主管部门，同时自然资源主管部门和乡（镇）人民政府也承担相应的协同管理和协助执法职责。以下是对这一问题的详细分析：
主要执法主体：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》第七十八条的规定，农村村民未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地建住宅的，由县级以上人民政府农业农村主管部门负责查处。这包括责令退还非法占用的土地，以及限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋。
- 农业农村部门不仅负责农村宅基地的改革和管理，还承担起草相关法律法规草案及政策、指导宅基地分配使用流转、纠纷仲裁管理以及违法用地查处等职责。这进一步明确了农业农村部门在宅基地违法行为查处中的主体地位。
协同管理部门：
- 自然资源主管部门：虽然农业农村部门是主要的执法主体，但自然资源主管部门也承担着重要的协同管理职责。特别是对于涉及违反土地利用总体规划、占用农用地特别是耕地等违法宅基地建设行为，自然资源主管部门有权进行查处，并依法作出相应的处罚决定。
- 乡（镇）人民政府：乡（镇）人民政府在日常管理中对维护农村宅基地使用秩序起到重要作用。它们有责任对本辖区内的宅基地使用情况进行监督管理，发现违法建设行为可以责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。乡（镇）政府凭借其贴近基层、反应迅速的优势，在及时发现和制止正在进行的违法建设行为方面发挥着不可替代的作用。
法律建议：
- 如果您发现宅基地存在违法行为，如未经批准非法占用土地建住宅等，可以向县级以上人民政府农业农村主管部门举报，由其负责查处。
- 同时，您也可以向自然资源主管部门或乡（镇）人民政府反映情况，他们将在各自的职责范围内协助处理。
可能的法律后果：
- 对于非法占用土地建住宅的行为，农业农村主管部门将责令退还非法占用的土地，并限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋。
- 如果逾期不拆除，相关部门可能会采取强制拆除等措施，并可能对违法行为人处以罚款等行政处罚。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您在宅基地方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。