针对您提出的“员工违规了公司规章制度罚款合法吗”这一问题，我将从法律角度和实际操作层面为您进行详细解答。
首先，从法律层面来看，公司对员工进行罚款并非绝对合法。根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，公司制定规章制度时需确保其合法性、合理性，并经过民主程序制定，同时向员工公示或告知。若公司规章制度本身不合法，或未履行相应程序，那么基于此制度对员工进行的罚款则可能不被法律支持。
进一步来说，即便公司规章制度合法且已向员工公示，罚款行为也需满足以下条件才可能被视为合法：
罚款金额应合理：罚款金额不应过高，应与员工的违规行为相适应。通常，罚款金额不应超过员工月工资的一定比例（这一比例可能因地区或具体法规而异，但一般不超过20%），以确保不会对员工的基本生活造成过大影响。
罚款应具有正当性：罚款的目的是为了维护公司的正常秩序和利益，而非惩罚员工或谋取不正当利益。公司应确保罚款行为与违规行为的性质、严重程度相匹配，避免滥用罚款权力。
然而，在实际操作中，公司对员工进行罚款往往存在争议。一方面，罚款可能被视为侵犯员工权益的行为，尤其是当罚款金额过高或罚款理由不充分时。另一方面，员工有权对不合理的罚款提出异议，并通过法律途径维护自己的权益，如向当地劳动监管部门投诉或提交劳动仲裁申请。
建议：
对于公司而言，在制定和执行罚款制度时应谨慎行事，确保其合法性和合理性。公司可以考虑采用其他非惩罚性的管理手段，如警告、调岗、再培训等，来应对员工的违规行为。
对于员工而言，如果认为公司的罚款行为不合理或违法，可以积极与公司沟通协商，寻求解决方案。若协商无果，员工可以依法向劳动监管部门投诉或提交劳动仲裁申请，以维护自己的合法权益。
综上所述，公司对员工进行罚款并非绝对合法，其合法性取决于公司规章制度的合法性、罚款金额的合理性以及罚款行为的正当性。在实际操作中，公司应谨慎使用罚款手段，员工也应积极维护自己的合法权益。