针对您提出的“公司对违规公司制度处罚员工罚款是否合法”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

一、法律框架下的罚款权

在我国现行法律框架下，企业并无直接的罚款权。这意味着，公司不能随意对员工进行罚款，尤其是以数额为计的罚款。法律并未赋予企业这样的权力，因此，公司若直接对员工进行罚款，可能涉及违法。

二、合法合规的替代方案

虽然企业不能直接罚款，但可以通过合法合规的规章制度及程序来达到规范员工行为的目的。这包括：

1. 完善规章制度：

   • 企业应制定合法合理的规章制度，明确员工的行为规范和违规后果。
   • 规章制度需经民主程序制定，如职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。
   • 规章制度需通过有效方式公示或告知员工，确保员工了解并遵守。

2. 明确可扣除工资的情形：

   • 员工因故意或重大过失造成公司经济损失时，企业可要求赔偿，但需遵守相关法律规定，如每月扣除的工资不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
   • 企业可依法从员工工资中代扣个人所得税、社会保险费等法定费用。

3. 确保罚款程序的公正性（若涉及赔偿等类似罚款的情境）：

   • 及时记录员工违纪的时间、地点、具体行为，并固定证据。
   • 在处理前，将违纪事实和拟采取的措施告知员工，给予其申辩机会。

三、违规处理的合法方式

对于员工违反公司制度的行为，企业可以选择以下合法方式进行处理：

• 警告或记过：通过书面警告或记过的方式，提醒员工注意其行为规范。
• 解除劳动合同：若员工严重违反公司制度，且给公司带来重大损失或影响，企业有权解除劳动合同，但需遵守相关法律规定，如提前通知、支付经济补偿等（若符合法定无需补偿情形则除外）。

四、加强沟通与教育

无论采取何种处理方式，企业都应加强与员工的沟通与教育。通过沟通了解员工的想法和意见，帮助员工认识错误并改正行为。同时，企业也可以通过培训、宣传等方式提高员工的法律意识和规章制度意识。

总结

公司对违规公司制度处罚员工罚款并不合法。企业应通过完善规章制度、明确可扣除工资的情形、确保罚款程序的公正性（若涉及赔偿等类似罚款的情境）以及加强沟通与教育等方式来合法合规地规范员工行为。这样既能维护公司秩序，又能保障员工权益，实现企业与员工的和谐共赢。