针对您提出的“公司在自己的建设用地内挖沙遗留大坑该如何处理”的问题，这涉及到土地管理和环境保护的法律法规，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，无论是在耕地还是建设用地上，未经许可擅自挖沙、采石等行为，如果破坏了土地条件或造成了环境损害，都是不被允许的。根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，占用土地进行挖砂、采石等活动，若破坏了种植条件或造成土地荒漠化、盐渍化，将由县级以上人民政府自然资源主管部门、农业农村主管部门等按照职责责令限期改正或者治理，并可以并处罚款；若构成犯罪，还将依法追究刑事责任。
针对您公司的情况，我建议采取以下步骤进行处理：
立即停止挖沙行为：首先，公司应立即停止在建设用地内的挖沙活动，防止问题进一步恶化。
评估损害程度：接下来，公司应委托专业机构对挖沙遗留的大坑进行评估，确定其对土地条件和环境的具体损害程度。
制定治理方案：根据评估结果，公司应制定详细的治理方案，包括如何回填大坑、恢复土地条件、防止水土流失和环境污染等措施。
向相关部门报告：公司应主动向当地自然资源主管部门或农业农村主管部门报告情况，并提交治理方案。相关部门将根据职责对公司进行指导、监督，并可能要求公司限期完成治理工作。
执行治理方案并接受监督：公司应按照治理方案的要求，及时执行治理工作，并接受相关部门的监督和检查。确保治理工作达到预期效果，恢复土地条件和环境质量。
承担法律责任：如果公司的挖沙行为已经违反了相关法律法规，公司应积极配合相关部门的调查和处理工作，并承担相应的法律责任，包括罚款、恢复原状等。
最后，我想强调的是，企业在发展过程中应严格遵守国家法律法规，保护土地资源和环境质量。对于已经造成的问题，企业应积极承担责任，采取有效措施进行治理和恢复。希望以上解答能对您有所帮助。