员工擅自兼职并将收入上交，这一行为本身并不直接决定其违法性，违法与否主要取决于兼职行为是否违反了相关法律法规或单位规章制度。以下是对此问题的详细分析：
一、法律层面分析
《劳动法》与《劳动合同法》的规定：
- 我国《劳动法》并未明确禁止员工在业余时间兼职，这为员工兼职提供了法律基础。
- 《劳动合同法》第三十九条第四项规定，劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，若对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的，用人单位可以解除劳动合同。这一条款是判断兼职行为是否违法的重要依据。
竞业限制与保密协议：
- 若员工与原单位签订了竞业限制协议或保密协议，应严格遵守相关约定。在协议约定的期限和范围内，不得从事与原单位有竞争关系的兼职工作或泄露商业秘密。否则，将构成违法行为，甚至可能承担刑事责任。
二、单位规章制度层面分析
单位规章制度的约束：
- 虽然法律未禁止兼职，但单位规章制度中可能包含禁止或限制兼职的条款。员工应仔细查阅劳动合同和员工手册，确保兼职行为不违反单位规定。
- 若单位规章制度明确禁止兼职，而员工擅自兼职，即使将收入上交，也可能面临单位的处罚，如警告、罚款甚至解除劳动合同。
规章制度的合法性：
- 用人单位的规章制度需要符合法律规定的程序制定，即内容合法合理、经过民主程序制定且已向员工公示告知，才具有法律效力。一旦员工违反这些规定，用人单位可以依据规章制度对员工进行相应的处罚。
三、实际操作层面分析
兼职行为的影响：
- 员工需评估兼职是否会对原单位的工作任务造成负面影响，如时间冲突、精力分散等。若兼职导致本职工作受损，即使将收入上交，员工也可能需承担相应责任。
收入上交的性质：
- 员工将兼职收入上交，这一行为本身并不改变兼职行为的性质。违法与否仍取决于兼职行为是否违反了相关法律法规或单位规章制度。
四、建议与注意事项
仔细检查规章制度：
- 员工在决定兼职前，应认真阅读原单位的劳动合同和员工手册，确保兼职行为符合单位规章制度要求。
充分沟通协商：
- 若兼职行为可能涉及敏感问题，如竞业限制或商业秘密保护，员工应与原单位进行充分沟通并征得同意。
合理安排时间与精力：
- 员工应合理规划时间，确保兼职不会干扰本职工作的完成质量和效率。
保留证据维护权益：
- 在兼职过程中，员工应注意保留相关证据，如合同、工资单、工作记录等，以备不时之需，维护自己的合法权益。
总结来看，员工擅自兼职并将收入上交，这一行为本身并不直接决定其违法性。违法与否主要取决于兼职行为是否违反了相关法律法规或单位规章制度。因此，员工在决定兼职前，应充分了解相关法律法规和单位规章制度，谨慎评估兼职行为可能带来的影响，并确保自己的行为符合法律和单位要求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。