员工做公司两个部门的工作是否合法，需分情况讨论：
如果员工做公司两个部门的工作是公司内部的正常工作安排，且不影响员工完成本职工作，同时也没有违反公司规章制度或劳动合同的约定，那么这种安排是合法的。
- 在实际工作中，公司可能会因为业务需要、人员调整或员工个人能力等因素，安排员工兼任两个部门的工作。只要这种安排不违反法律法规、公司规章制度以及劳动合同的约定，且员工能够胜任并按时完成工作任务，就是合法的。
如果员工做公司两个部门的工作导致无法完成本职工作，或者违反了公司规章制度、劳动合同的约定，甚至可能泄露公司商业秘密等，那么这种安排可能是不合法的。
- 例如，如果员工因为兼任两个部门的工作而频繁出错、延误工作进度，或者违反了公司关于兼职、利益冲突等方面的规定，公司有权要求员工改正或解除劳动合同。
- 另外，如果员工在兼任两个部门工作时，泄露了公司的商业秘密或敏感信息，还可能构成违法行为，需要承担相应的法律责任。
从劳动合同法的角度来看，员工同时做两个岗位的工作并不直接违反法律规定，但需注意可能引发的法律问题。
- 劳动合同法主要关注的是劳动合同的签订、履行、变更、解除和终止等方面，对于员工是否可以同时做两个岗位的工作并没有直接的规定。
- 但是，如果员工因为兼任两个岗位的工作而影响了本职工作的完成，或者违反了劳动合同中关于工作内容、工作地点、工作时间等方面的约定，公司有权依据劳动合同法的规定解除劳动合同。
法律建议：
- 对于员工而言，如果公司安排你做两个部门的工作，建议先仔细阅读劳动合同和公司规章制度，了解自己的权利和义务。如果认为这种安排可能影响自己的工作效果或违反相关规定，可以与公司进行沟通协商，寻求合理的解决方案。
- 对于公司而言，在安排员工做两个部门的工作时，应充分考虑员工的实际能力和工作负荷，确保这种安排不会影响员工完成本职工作。同时，公司也应完善相关规章制度，明确员工在兼任多个岗位时的权利和义务，以避免可能引发的法律问题。
可能引发的法律后果：
- 如果员工因为兼任两个部门的工作而违反了公司规章制度或劳动合同的约定，公司有权依据相关规定对员工进行处罚，包括警告、罚款、解除劳动合同等。
- 如果员工在兼任两个部门工作时泄露了公司商业秘密或敏感信息，还可能构成侵犯商业秘密罪等违法行为，需要承担刑事责任。
综上所述，员工做公司两个部门的工作是否合法需根据具体情况来判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。