仲裁劳动关系时确实可以协商赔偿。以下是对这一问题的详细解答：

1. 仲裁期间的调解环节：

   • 在劳动仲裁期间，调解是一个法定的环节。仲裁机构会依据自愿、合法的原则，推动双方当事人进行和解。
   • 如果调解成功，仲裁庭会出具调解书，该调解书在双方签收后即生效，其效力与裁决书相同，且可以强制执行。

2. 调解赔偿的好处：

   • 对于劳动者而言，调解赔偿可以快速获得赔偿，节省时间和精力。
   • 对于用人单位而言，调解赔偿有利于维护其形象，降低纠纷带来的不良影响。

3. 调解赔偿的具体操作：

   • 双方可以在仲裁员的主持下，就工资、补偿等争议进行协商，确定赔偿金额和支付方式。
   • 如果一方不履行调解赔偿协议，另一方有权向法院申请强制执行。

4. 调解赔偿金额的确定：

   • 调解赔偿的金额需要综合考虑劳动者的实际损失、工作年限、工资水平等多方面因素。
   • 双方应在平等、自愿的基础上进行协商，确保赔偿金额的合理性和公平性。

5. 后续行动建议：

   • 如果在仲裁过程中达成调解赔偿协议，建议双方仔细阅读协议内容，确保自己的权益得到充分保障。
   • 如果一方不履行协议，另一方应及时向法院申请强制执行，以维护自己的合法权益。

综上所述，仲裁劳动关系时确实可以协商赔偿，且调解赔偿对于双方当事人而言都有诸多好处。在协商过程中，双方应秉持平等、自愿的原则，确保赔偿金额的合理性和公平性。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。