针对您提出的“合作合同纠纷中对方承认收了保证金，愿意继续履行合作合同义务，是否构成诉讼时效抗辩”的问题，以下是我的详细解答：

1. 关于诉讼时效抗辩的基本理解：

   • 诉讼时效抗辩是指被告在诉讼中提出原告的请求权已经超过了法律规定的诉讼时效期间，从而拒绝履行其义务的一种抗辩方式。

2. 对方承认收保证金并愿意继续履行合同义务的情况分析：

   • 在合作合同纠纷中，如果对方承认已经收取了保证金，并且明确表示愿意继续履行合作合同义务，这通常表明对方并没有否认其合同义务，也没有以诉讼时效为由进行抗辩。
   • 诉讼时效抗辩的成立，需要被告明确提出原告的请求权已经超过了诉讼时效期间，并且这一抗辩需要得到法院的认可。在对方已经承认合同义务并愿意继续履行的情况下，诉讼时效抗辩通常不会成立。

3. 诉讼时效抗辩的构成要件：

   • 诉讼时效抗辩的构成要件包括：原告的请求权已经超过了法律规定的诉讼时效期间；被告在诉讼中明确提出了诉讼时效抗辩；法院经过审查认为诉讼时效抗辩成立。
   • 在您描述的情况下，由于对方已经承认了合同义务并愿意继续履行，因此并不满足诉讼时效抗辩的构成要件。

4. 法律建议：

   • 如果您在合作合同纠纷中遇到了对方承认收保证金并愿意继续履行合同义务的情况，那么您通常不需要担心诉讼时效抗辩的问题。
   • 但是，为了确保您的权益得到充分保障，建议您还是尽快与对方协商解决纠纷，或者通过法律途径（如起诉）来维护您的合法权益。
   • 在处理此类纠纷时，建议您保留好所有与合同相关的证据，如合同文本、付款凭证、沟通记录等，以便在需要时能够提供充分的证据支持。

综上所述，在合作合同纠纷中，如果对方承认收了保证金并愿意继续履行合作合同义务，这通常不构成诉讼时效抗辩。如果您在处理此类纠纷时遇到任何问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。