关于建设工程内部承包合同的管辖问题，以下是我的详细解答：

1. 合同明确约定管辖法院的情况：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，若合同明确约定了管辖法院，且该约定不违反级别管辖和专属管辖规定，则应按约定确定管辖。
   • 律师见解：在审查合同约定的管辖是否有效时，需关注该约定是否违反了法律的强制性规定。若合同中的管辖条款合法有效，则双方应遵守该约定，向约定的法院提起诉讼。

2. 合同未明确约定管辖法院的情况：

   • 一般管辖规则：若合同未明确约定管辖法院，则通常由被告住所地或合同履行地法院管辖。在建设工程内部承包合同中，合同履行地一般为工程所在地。
   • 专属管辖的适用：由于建设工程内部承包合同与建设工程施工紧密相关，涉及正在施工的不动产，因此不少法院在司法实践中将其视作建设工程施工合同纠纷，适用专属管辖。即，由不动产所在地（工程所在地）人民法院管辖。
   • 律师见解：在处理此类纠纷时，应首先审查合同中是否有有效的管辖约定。若无有效约定，则需考虑是否适用专属管辖。若纠纷本质上属于建设工程施工合同纠纷，则应按照不动产纠纷确定管辖，即由工程所在地人民法院专属管辖。

3. 管辖权异议的处理：

   • 提出异议的期限：当事人应在提交答辩状期间提出管辖权异议，并向受理案件的法院提交书面申请并说明理由。
   • 法院的审查与裁定：法院会对异议进行审查，主要依据《民事诉讼法》及相关司法解释。若异议成立，法院会裁定将案件移送有管辖权的法院；若异议不成立，法院会裁定驳回。
   • 上诉权利：当事人对裁定不服的，有权在裁定书送达之日起10日内向上一级法院提起上诉。上一级法院会对上诉进行审理并作出终审裁定。

4. 特殊情况的考虑：

   • 涉及多个工程地点的情况：若合同涉及多个工程地点，需准确确定主要施工行为地以明确管辖法院。这通常需要根据合同的具体内容、施工进度等因素进行综合判断。
   • 合同中约定的管辖条款存在争议的情况：当合同中约定的管辖条款存在争议时，应依据法律规定和合同的具体内容来认定其效力。若条款违反了法律的强制性规定或存在其他无效情形，则该条款应被视为无效。

综上所述，建设工程内部承包合同的管辖问题需根据合同的具体约定、法律的规定以及司法实践中的做法来综合判断。在处理此类纠纷时，建议双方充分沟通、协商，并寻求专业律师的帮助以确保自身权益得到妥善保护。如有任何法律问题，欢迎直接向我咨询。