针对您提出的“施工总承包单位未缴纳农民工工资保证金，人社部门会有什么措施”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

根据《工程建设领域农民工工资保证金规定》，施工总承包单位有义务按规定存储农民工工资保证金，这一保证金专项用于支付被拖欠的农民工工资。若施工总承包单位未按规定存储，人社部门将采取以下一系列措施：

1. 责令限期改正：

   • 人社部门会首先要求施工总承包单位在限期内改正未缴纳保证金的行为，给予其一个纠正错误的机会。

2. 逾期未改正的处罚：

   • 若施工总承包单位在限期内未改正，人社部门将根据工程合同价款的不同，处以相应的罚款。具体来说，若工程合同价款低于100万元，将处5万元以上10万元以下的罚款；若工程合同价款在100万元以上，则处工程合同价款1%以上1.5%以下的罚款。
   • 同时，对单位主要负责人和直接责任人员，人社部门也将处以1万元以上3万元以下的罚款。
   • 此外，人社部门还可能责令项目停工，以进一步督促施工总承包单位履行其义务。

3. 降低或吊销资质：

   • 对于情节严重的施工总承包单位，人社部门将联合相关行业工程建设主管部门，给予其限制承接新工程、降低资质等级、吊销资质证书等严厉处罚。这些处罚将严重影响施工总承包单位在建筑市场的活动能力。

4. 影响企业信誉和市场准入：

   • 未缴纳农民工工资保证金还将损害施工总承包单位的企业信誉评级，进而影响其市场准入和招投标活动。被列入拖欠农民工工资失信联合惩戒对象名单的企业，在招投标、融资贷款等方面将受到限制。

5. 法律诉讼和赔偿风险：

   • 若因未缴纳工资保证金导致农民工工资无法按时足额支付，施工总承包单位可能面临法律诉讼和赔偿责任。这包括支付拖欠的工资、经济损失赔偿和精神损害赔偿等，情节严重的，相关责任人甚至可能承担刑事责任。

综上所述，施工总承包单位应严格遵守法律法规，按规定存储农民工工资保证金，以避免可能的法律风险和不良后果。同时，农民工也应积极了解自己的合法权益和维权途径，在遭遇工资拖欠时及时采取合法措施维护自身权益。