关于特殊工时是否可以按用工所在地办理的问题，这主要取决于您所在地区的具体规定。不过，我可以根据一些地区的普遍做法和相关政策，为您提供一个较为全面的解答。
首先，特殊工时工作制，包括不定时工作制和综合计算工时制，是针对因工作性质或生产特点限制，无法实行标准工时制的企业和岗位而设立的一种弹性工时制度。这种制度的实施，需要经过相关劳动保障行政部门的审批。
在办理特殊工时工作制审批时，不同地区可能有不同的规定。以广西壮族自治区为例，根据《广西壮族自治区特殊工时制度行政许可办法》，企业申请实行特殊工时制度，应向企业工商登记注册地的县级以上同级劳动保障行政部门提出。这意味着，在广西，特殊工时的办理通常是基于企业的工商登记注册地，而非用工所在地。然而，也存在一些特殊情况，如自治区直属驻邕企业及在自治区工商行政管理部门登记注册的其他驻邕企业，它们申请实行特殊工时制度时，是向自治区劳动保障行政部门提出的。
另一方面，虽然甘肃省的相关政策解读中并未直接提及特殊工时是否可以按用工所在地办理，但从其政策内容可以看出，甘肃省对于特殊工时的管理也是有着明确规定的，并且强调了审批管理的规范化和优化。这暗示了特殊工时的办理需要遵循一定的程序和规定，而这些程序和规定很可能也是基于企业的注册地或相关行政管辖区域来设定的。
综合来看，特殊工时是否可以按用工所在地办理，并没有一个统一的答案。它取决于您所在地区的具体规定和政策。因此，我建议您：
查阅当地政策：首先，您需要查阅所在地区关于特殊工时工作制审批的具体政策和规定，了解办理特殊工时的具体要求和程序。
咨询劳动保障行政部门：如果您对政策有疑问或不确定如何操作，可以直接咨询当地的劳动保障行政部门，他们将能够为您提供最准确、最权威的解答。
准备相关材料：根据政策要求，准备好申请特殊工时工作制所需的相关材料，如企业法人营业执照副本复印件、企业工会对实行特殊工时制度的意见等。
提交申请并等待审批：按照政策规定的程序，向相关部门提交申请，并等待审批结果。
总之，特殊工时的办理需要遵循当地的具体政策和规定。希望我的解答能够对您有所帮助，如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。