农村自建房小包工队是否违法，需视具体情况而定。

首先，从法律角度来看，承包方应具备相应的施工资质。如果小包工队没有相应的建筑施工资质，却承接了农村自建房的施工工程，那么这种行为可能违反相关的建筑法律法规。因为建筑施工涉及到公共安全，需要专业的技术和资质来确保工程的质量和安全性。

其次，如果小包工队在施工过程中违反了相关的建筑规范、安全标准或者环保要求，也可能面临法律责任。比如，如果施工导致环境污染、安全事故或者房屋质量问题，小包工队及其成员可能需要承担相应的赔偿责任，甚至可能受到刑事处罚。

然而，如果小包工队具备相应的施工资质，并且严格按照法律法规和建筑规范进行施工，那么他们的行为就是合法的。在这种情况下，他们可以与农户签订合法的施工合同，明确双方的权利和义务，确保工程的顺利进行。

因此，对于农村自建房小包工队是否违法的问题，不能一概而论。需要具体分析小包工队是否具备施工资质、是否遵守法律法规和建筑规范等因素。如果农户需要修建自建房，建议选择具备资质、信誉良好的施工队伍，并签订合法的施工合同，以确保工程的质量和安全性。如果有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会提供专业的法律建议和支持。