针对您提出的“司法解释对超过申请劳动争议时效的案件，法院如何判决”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确几个关键概念：
诉讼时效：它是指权利人在一定期间内不行使权利，即可能在某种程度上丧失请求利益的时效制度。对于一般的民事权利，向人民法院请求保护的诉讼时效期间通常为三年。但劳动争议有其特殊性。
劳动仲裁时效：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
确认之诉与诉讼时效的关系：确认之诉是指原告要求法院确认其主张的法律关系存在或不存在的请求。根据《最高人民法院关于审理民事案件适用诉讼时效制度若干问题的规定》，确认之诉并不适用诉讼时效制度。
现在，结合您的问题和提供的参考信息，我们可以这样理解：
对于超过劳动仲裁时效的劳动争议案件，如果劳动者向劳动仲裁委员会申请仲裁，仲裁委可能会以超过时效为由驳回申请。但这并不意味着劳动者完全丧失了救济途径。劳动者仍然可以向法院提起诉讼。
在诉讼过程中，法院会审查劳动者的诉讼请求和提供的证据。如果劳动者的诉讼请求是确认劳动关系等确认之诉，并且提供了充分的证据来证明其主张，那么即使超过了劳动仲裁时效，法院也可能判决支持劳动者的诉讼请求，因为确认之诉并不受诉讼时效的限制。
以参考信息中的案例为例，姜某虽然超过了劳动仲裁时效，但他向法院提起了确认劳动关系的诉讼，并提供了充分的证据来证明其与某客运公司存在劳动关系。最终，法院一审判决确认姜某与该公司存在劳动关系。
综上所述，对于超过申请劳动争议时效的案件，法院会根据具体情况进行审理和判决。如果劳动者的诉讼请求是确认之诉，并且提供了充分的证据，那么即使超过了时效，法院也可能支持劳动者的诉讼请求。但需要注意的是，每个案件都有其独特性和复杂性，因此在实际操作中还需要根据具体情况进行分析和判断。