针对“起诉确认劳动关系超过时效法院一般怎么判决”的问题，首先需要明确的是，确认劳动关系的时效通常为一年，这是根据相关法律法规规定的。然而，在实际操作中，法院会根据具体情况来判断是否支持劳动者的诉求。

一般来说，如果劳动者能够证明存在不可抗力等正当理由导致时效中断或中止，法院可能会支持其确认劳动关系的诉求。这是因为，尽管时效已经经过，但劳动者有合理的解释和证据来支持其未能及时行使权利的原因。

相反，如果劳动者无法说明时效经过的合理原因，且用人单位否认劳动关系的存在，那么法院可能会因为超过时效而驳回劳动者的请求。这是因为，在法律上，时效制度是为了督促权利人积极、及时地向相关义务人主张权利，以尽快稳定相关民事权利义务关系。

然而，也需要注意的是，在某些特殊情况下，即使超过了时效，法院也可能会基于公平原则综合考量后作出判决。这通常涉及到劳动者的权益保护等重要因素，法院会根据具体情况来判断是否给予劳动者一定的法律救济。

举例来说，如果劳动者因为某些特殊原因（如生病、意外等）无法及时行使权利，或者用人单位在劳动关系存续期间存在违法行为（如未签订劳动合同、未缴纳社保等），这些都可能影响法院的判决结果。

综上所述，起诉确认劳动关系超过时效后法院的判决结果具有不确定性，需要根据具体情况来分析。劳动者在提起诉讼前，应该尽可能收集相关证据来支持自己的诉求，并咨询专业律师以获取更准确的法律建议。