关于“甲方开除乙方怎么处理”的问题，这需要根据甲方和乙方之间的具体法律关系（即是劳动关系还是合作关系）以及相关法律法规来进行详细解答。
一、劳动关系情况下的处理
合法开除的情形与依据：
- 甲方在开除乙方时，必须确保有合法的理由，如乙方在试用期间不符合录用条件、严重违反甲方规章制度、严重失职给甲方造成重大损害等。
- 这些情形通常会在劳动合同或相关法律法规中明确规定。
开除的法定程序：
- 甲方需要按照法定的程序进行开除，包括递交解除申请书、填写解除劳动合同审批表并报主管审批、通知乙方办理工作交接等。
- 确保整个流程符合法律法规的要求，以避免潜在的法律风险。
违法开除的后果：
- 如果甲方无法定理由或未按照法定程序开除乙方，将构成违法解除，需要承担支付赔偿金等法律责任。
- 赔偿金通常是经济补偿标准的二倍，具体数额根据乙方在本单位的工作年限计算。
二、合作关系情况下的处理
合作关系的性质：
- 在合作关系中，甲方和乙方是平等的合作主体，甲方通常没有权力直接开除乙方人员。
- 乙方人员的管理和任用由乙方自行负责，甲方无权直接干预。
基于合作协议的处理：
- 如果甲乙双方在合作协议中有特别约定，如乙方人员出现某些特定行为影响合作项目推进或损害甲方利益时，甲方有权要求乙方更换相关人员。
- 在这种情况下，甲方应依据合作协议与乙方进行协商，要求乙方进行相应处理。但这并不构成“开除”，而是基于合作约定的一种要求或建议。
总结与建议
在处理甲方开除乙方的问题时，首先需要明确双方之间的法律关系。如果是劳动关系，甲方必须确保有合法的理由和遵循法定的程序进行开除；如果是合作关系，甲方应依据合作协议与乙方进行协商处理。在任何情况下，甲方都应遵守相关法律法规和合同约定，确保行为的合法性和合理性。同时，建议甲方在处理此类问题时咨询专业法律人士的意见，以避免潜在的法律风险。