员工申请仲裁不合理，公司能反诉。在劳动仲裁中，虽然通常使用“反申请”这一术语而非“反诉”，但实质上公司是可以针对员工的仲裁请求提出自己的主张和请求的。

1. 反申请的定义与条件：

   • 反申请是指在劳动仲裁程序中，被申请人（即公司）以原仲裁申请人（即员工）为被申请人，向劳动争议仲裁委员会提出的与原仲裁请求在事实上和法律上有牵连的、目的在于抵销或吞并原仲裁请求的独立的请求。
   • 公司提出反申请需要符合一定条件，如必须在规定的答辩期内提出，且反申请请求应与员工的仲裁请求基于同一事实或法律关系等。

2. 反申请的目的与意义：

   • 通过反申请，公司可以维护自身的合法权益，确保在劳动仲裁中不会仅仅处于被动应诉的地位。
   • 反申请有助于仲裁庭全面审查双方的争议，从而作出更公正的裁决。

3. 反申请的具体操作：

   • 公司需要准备充分的证据来支持其反申请请求，包括相关的劳动合同、考勤记录、工资发放凭证等。
   • 在提出反申请时，应明确被反申请人、具体的反申请请求和事实理由等，以确保反申请的合法性和有效性。

4. 法律后果与注意事项：

   • 如果公司的反申请被仲裁庭接受并审理，那么仲裁庭将根据双方的证据和陈述进行综合判断，依法作出裁决。
   • 公司在提出反申请时，必须确保其事实和法律依据充分，且要在规定期限内提交相关材料，否则可能面临不予受理等风险。

综上所述，员工申请仲裁不合理时，公司是有权提出反申请的。但公司在行使这一权利时，应确保遵守相关的法律程序和规定，以维护自身的合法权益。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。