当您的机动车被第三方开走并发生违章时，您可以按照以下步骤进行处理：
一、确认违章信息
首先，您需要通过交通管理部门的官方网站、手机应用程序或线下服务窗口，查询并确认违章的具体情况，包括违章时间、地点、违法行为等详细信息。这是处理违章的第一步，也是后续处理的基础。
二、与实际驾驶人沟通
明确驾驶人：
- 如果您能确定实际驾驶人，应与其进行沟通，明确违章责任，并要求其承担处理违章的义务。
- 驾驶人需携带本人驾驶证、身份证和车辆行驶证，前往交警大队或指定的违章处理点办理违章处理手续，包括缴纳罚款等。
驾驶人配合处理：
- 如果驾驶人愿意配合处理，您可以与其一同前往交警部门或通过线上渠道处理违章。
- 确保在规定时间内完成处理，以避免产生滞纳金等额外费用。
驾驶人不配合处理：
- 如果驾驶人不配合处理，您作为车主可能需要先自行处理违章。
- 处理后，您可以根据借车协议、聊天记录等相关证据，通过协商或民事诉讼的方式向驾驶人追偿因处理违章所产生的费用。
三、车主自行处理
无法确定驾驶人：
- 如果您无法确定实际驾驶人，作为车辆的所有人，您可能需要先承担违章责任。
- 您应尽力收集证据，如调取监控录像、回忆车辆使用情况等，以证明违章行为并非自己所为。
向交通管理部门说明情况：
- 在必要时，您可以向交通管理部门说明情况，并申请复核。
- 提供您收集到的证据，协助交通管理部门进行复核，以期减轻或免除您的责任。
四、注意事项
及时处理：
- 无论是由驾驶人还是车主处理违章，都应在规定时间内完成处理，以避免产生不必要的滞纳金等费用。
保留证据：
- 在处理过程中，务必保留好所有相关证据，如聊天记录、借车协议、监控录像等，以备后续使用。
法律途径：
- 如果遇到驾驶人拒不配合处理或无法联系到驾驶人的情况，您可以通过法律途径来维护自己的权益。
综上所述，当您的机动车被第三方开走并发生违章时，您应首先确认违章信息，并与实际驾驶人进行沟通。根据驾驶人是否配合处理的情况，采取相应的措施进行处理。如果无法确定驾驶人或驾驶人拒不配合处理，您作为车主可能需要先自行处理违章，并通过法律途径向驾驶人追偿相关费用。