单位收各子公司的房租是否合法，取决于具体的法律关系和合同约定。以下是对此问题的详细分析：

1. 从公司法人独立性角度：

   • 子公司作为独立的法人实体，拥有自己的财产和经营权。母公司（即单位）通常不能直接干预子公司的经营，包括收取房租这一行为。
   • 除非母公司与子公司之间存在明确的合同约定，或者母公司依法对子公司享有某种特定的权益（如股权控制、债权关系等），否则母公司无权单方面决定收取子公司的房租。

2. 从租赁合同角度：

   • 如果母公司与子公司之间签订了租赁合同，并且合同中明确规定了房租的支付条款，那么母公司收取房租就是合法的。
   • 租赁合同应当遵循平等、自愿、公平和诚实信用的原则，双方应当在合同中明确约定租赁物、租赁期限、租金及其支付方式等关键条款。

3. 从税法角度：

   • 母公司收取子公司的房租，如果符合税收法规的规定，并且依法申报纳税，那么这一行为在税法上也是合法的。
   • 需要注意的是，房租收入可能需要缴纳相应的税费，如增值税、房产税等。母公司应当确保自己的税务合规性。

4. 特殊情况：

   • 如果母公司与子公司之间存在关联交易、资产重组、债务重组等特殊情况，那么房租的收取可能需要遵循更复杂的法律规则和监管要求。
   • 在这些情况下，母公司应当咨询专业的法律顾问或会计师，以确保自己的行为符合相关法律法规的规定。

综上所述，单位收各子公司的房租是否合法，取决于具体的法律关系和合同约定。如果母公司与子公司之间存在明确的合同约定，并且依法履行了相关的税务和监管要求，那么这一行为就是合法的。否则，母公司可能面临法律风险或税务风险。如有进一步疑问或需要具体法律建议，请直接向我咨询。