行政诉讼开庭已明确告知的主审法官审判长不到庭，一般不属于合法情况，且有可能构成违反法定程序。具体分析如下：

一. 主审法官审判长应到庭

1. 职责所在：根据行政诉讼法的相关规定，主审法官审判长是负责主持庭审、确保庭审程序合法、公正进行的关键人员。其应当亲自到庭，履行审判职责。
2. 庭审的严肃性：庭审是司法程序中的重要环节，具有严肃性和权威性。主审法官审判长不到庭，会影响庭审的严肃性和权威性，也可能影响当事人的合法权益。

二. 不到庭可能违反法定程序

1. 程序规定：行政诉讼法及其实施细则等法律法规对庭审程序有明确规定，包括审判人员的组成、庭审的进行等。主审法官审判长不到庭，可能违反这些程序规定。
2. 影响当事人权益：主审法官审判长不到庭，可能导致庭审无法顺利进行，或者庭审过程中出现问题无法及时解决，从而影响当事人的合法权益。例如，当事人可能无法及时提出异议、陈述观点等。

三. 特殊情况下的处理

1. 正当理由：如果主审法官审判长因正当理由（如突发疾病、紧急公务等）无法到庭，且已经及时告知当事人并采取了相应措施（如延期开庭、更换审判长等），则可能不构成违反法定程序。
2. 程序补救：在庭审过程中，如果发现主审法官审判长未到庭，且未采取相应补救措施，当事人可以及时向法庭提出异议，要求法庭采取相应措施确保庭审的合法性和公正性。

我建议：如果您在行政诉讼中遇到主审法官审判长不到庭的情况，应当及时向法庭提出异议，并关注法庭是否采取了相应补救措施。如有进一步需要，您可以继续咨询我。