大包用房抵农民工工资是不合法的。

首先，从法律角度来看，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这是《劳动法》对劳动者工资支付形式的明确规定。大包用房抵农民工工资，显然违反了这一规定，因为房屋并非货币形式，不能作为工资的支付手段。

其次，这种做法也损害了劳动者的合法权益。劳动者提供劳动后，有权获得相应的工资报酬。如果用房屋来抵偿工资，劳动者可能面临无法及时变现、房屋价值与工资不符等一系列问题，从而损害其合法权益。

最后，从实际操作层面来看，大包用房抵农民工工资也存在诸多风险。比如，房屋的所有权、使用权等可能存在争议，导致劳动者无法真正获得房屋；或者房屋的市场价值远低于劳动者的工资，使得劳动者遭受经济损失。

综上所述，大包用房抵农民工工资是不合法的，也损害了劳动者的合法权益。如果遇到这种情况，劳动者可以向劳动监察部门投诉，或者通过法律途径维护自己的权益。如果你在这方面有进一步的法律问题，可以直接向我咨询。