总包单位抵房给施工方这一行为，在符合一定条件下是合法的。以下从不同角度进行详细分析：
合法性基础
合同约定：如果总包单位与施工方在合同中明确约定了以房屋作为工程款的支付方式，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么这种抵房行为就是合法的。合同是双方意思自治的体现，只要双方达成一致，且内容合法，就应当受到法律的保护。
债务清偿：从债务清偿的角度来看，总包单位欠施工方工程款，双方协商以房屋来抵偿债务，这实际上是一种债务清偿的方式。只要双方对房屋的价值、交付时间、产权过户等事项达成一致，且房屋本身不存在权属纠纷或法律限制，这种清偿方式就是有效的。
潜在风险与注意事项
房屋权属问题：在抵房过程中，必须确保房屋的权属清晰，不存在抵押、查封等法律限制。如果房屋存在权属纠纷或法律限制，那么抵房行为可能会因无法办理产权过户而无效。
房屋价值评估：双方应当对房屋的价值进行合理评估，确保抵房的价值与工程款相当。如果房屋价值明显低于工程款，施工方可能会因此遭受损失；反之，如果房屋价值过高，总包单位则可能面临不必要的经济损失。
合同条款明确：在签订抵房合同时，双方应当明确约定房屋的交付时间、产权过户时间、违约责任等条款。这些条款的明确约定有助于减少后续纠纷的发生，保障双方的合法权益。
法律程序合规：抵房行为应当遵循相关的法律程序，如签订书面合同、办理产权过户手续等。如果违反法律程序，可能会导致抵房行为无效或产生其他法律后果。
法律后果
如果总包单位抵房给施工方的行为符合上述合法性基础，且双方遵循了相关的法律程序和注意事项，那么这种行为就是有效的，双方应当按照合同约定履行各自的义务。如果一方违反合同约定，另一方有权要求其承担违约责任或寻求其他法律救济途径。
总结与建议：总包单位抵房给施工方在符合合同约定、债务清偿条件，且房屋权属清晰、价值合理、合同条款明确、法律程序合规的情况下是合法的。然而，在实际操作中，双方应当谨慎对待抵房行为，确保所有事项都符合法律规定和合同约定。如果有任何疑问或不确定的地方，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。