关于联合体协议合同中未约定牵头方与其他方如何开票付款的问题，我的理解是这样的：

首先，结论并不是默认与牵头方进行。在联合体协议合同中，如果未明确约定开票付款的具体方式，那么并不能直接推断为默认与牵头方进行。这是因为联合体协议合同通常涉及多个参与方，各自的权利和义务应当在合同中明确约定。如果没有明确约定，就需要根据合同的其他条款、交易习惯以及相关法律法规来综合判断。

接下来，我将从几个角度对这个问题进行详细分析：

1. 合同约定优先：在联合体协议合同中，如果其他条款或者附件中有关于开票付款的约定，即使主合同中未明确提及，也应当遵循这些约定。因此，首先要仔细审查合同的所有内容，看是否有相关约定。

2. 交易习惯考量：如果合同中没有明确约定，且没有相关的交易习惯可以遵循，那么就需要根据公平、合理、诚实信用的原则，结合合同的实际履行情况，来协商确定开票付款的具体方式。这可能需要各方进行进一步的沟通和协商。

3. 法律法规依据：在法律法规方面，虽然没有直接规定联合体协议合同中开票付款的具体方式，但《民法典》等法律法规对于合同的履行、解释和争议解决等方面都有相关规定。在协商无果的情况下，可以依据这些法律法规来寻求解决方案。

综上所述，联合体协议合同中未约定牵头方与其他方如何开票付款时，并不能直接推断为默认与牵头方进行。而是需要根据合同的其他条款、交易习惯以及相关法律法规来综合判断，并协商确定具体的开票付款方式。如果你在这个问题上有进一步的疑问或者需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。