关于“打卡未上班公司怎么处罚”的问题，首先需要明确的是，公司对于员工的考勤管理应当遵循合法、合理和善意的原则，不能随意制定惩罚措施。以下是对这一问题的详细解答：
一、公司处罚员工的法律依据
公司可以通过规章制度来规定员工的考勤管理和相应的处罚措施，但这些规定必须符合国家法律法规的要求，不能侵犯员工的合法权益。例如，根据《劳动合同法》和相关规定，公司可以制定考勤制度，并对违反考勤制度的员工进行一定的处罚，但处罚措施必须合理且符合法律规定。
二、常见的处罚方式
扣工资：这是公司常用的一种处罚方式。但是，扣工资必须遵循一定的原则，不能随意扣除。例如，公司可以规定员工迟到或早退多少次后扣除一定比例的工资，但这个比例必须合理，不能过高，且必须明确告知员工。
警告或记过：对于轻微的考勤违规行为，公司可以给予员工警告或记过的处罚，以示惩戒。
解除劳动合同：对于严重违反考勤制度或公司规章制度的员工，公司有权解除劳动合同。但是，在解除劳动合同前，公司必须确保其行为符合法律规定的解除条件，并遵循相应的程序。
三、处罚的合理性判断
是否符合法律法规：公司的处罚措施必须符合国家法律法规的要求，不能违反相关规定。
是否合理且善意：公司制定处罚措施时应当考虑其合理性和善意性。例如，对于员工因特殊原因（如突发疾病、交通延误等）导致的迟到或早退，公司应当给予一定的宽容和理解，而不是一味地进行处罚。
是否与违纪行为相匹配：公司处罚员工的措施应当与其违纪行为的严重程度相匹配。对于轻微的违纪行为，可以采取较轻的处罚措施；对于严重的违纪行为，则可以采取更严厉的处罚措施。
四、实际案例分析
以上海某医疗公司为例，该公司因员工江某多次迟到而扣除了其大量工资。然而，法院最终判决公司支付江某工资差额，因为公司扣除工资的行为超出了合理范围，违反了法律规定。这个案例表明，公司在处罚员工时必须谨慎行事，确保其行为合法且合理。
五、建议
完善考勤制度：公司应当制定完善且合理的考勤制度，明确员工的考勤要求和相应的处罚措施。
加强沟通与教育：公司应当与员工保持良好的沟通，及时告知员工考勤制度的要求和变化，并对员工进行相关的教育和培训。
遵循法律程序：在处罚员工时，公司必须遵循法律规定的程序和要求，确保其行为合法且有效。
综上所述，公司在处理员工打卡未上班的问题时，应当遵循合法、合理和善意的原则，制定完善的考勤制度，并加强与员工的沟通与教育。同时，在处罚员工时，必须确保其行为符合法律规定，避免侵犯员工的合法权益。