结论前置：村集体把商业综合体出租给其他企业后，如果该企业降低出资金额，且此行为违反了租赁合同中的相关约定，那么该企业确实构成了违约。
详细分析：
合同约定的重要性：在租赁合同中，双方会明确约定各自的权利和义务，包括租赁期限、租金支付方式、出资金额（如押金、预付款等）以及违约责任等。这些约定是合同法律效力的体现，双方均应严格遵守。
降低出资金额的性质：如果企业在合同签订后擅自降低出资金额，这实际上是对合同约定的违反。无论这种降低是出于何种原因，只要合同中没有明确允许或规定此种情况，那么企业的行为就构成了违约。
违约责任的承担：根据《民法典》的相关规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。因此，如果该企业降低出资金额违反了合同约定，村集体有权要求其承担相应的违约责任，包括但不限于补足出资、支付违约金或赔偿损失等。
特殊情况的处理：当然，也存在一些特殊情况，比如合同中可能规定了某些情况下企业可以调整出资金额，或者双方后来达成了补充协议对出资金额进行了调整。在这些情况下，企业的降低出资金额行为可能不构成违约。但这种情况需要具体分析合同内容和双方后来的行为来确定。
综上所述，村集体把商业综合体出租给其他企业后，如果该企业降低出资金额且违反了合同约定，那么该企业确实构成了违约。村集体可以根据合同约定和法律规定要求其承担相应的违约责任。如果你有更具体的合同内容或相关情况需要咨询，请随时告诉我。