结论：合同一方当事人违反规定经商办企业签订的股权转让协议，其合法性需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从多个角度进行分析：

1. 违反规定经商办企业的性质：

   • 如果违反的是国家法律法规的强制性规定，如未经批准擅自经营特定行业或业务，那么这种行为本身可能构成违法，进而影响基于此行为签订的股权转让协议的合法性。根据《民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效，但是该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。因此，若违反的规定属于此类强制性规定，股权转让协议可能因违法而无效。
   • 如果违反的是公司内部规定或行业规范，而非国家法律法规的强制性规定，那么这种行为可能不会直接导致股权转让协议无效。但需要注意的是，如果公司内部规定或行业规范对股权转让有特定要求或限制，且这些要求或限制不违反法律法规的强制性规定，那么违反这些规定签订的股权转让协议可能因违反公司章程或行业规范而面临被撤销或无效的风险，具体取决于公司章程或行业规范的具体规定以及相关法律法规的适用。

2. 股权转让协议的签订过程：

   • 股权转让协议的签订应遵循自愿、公平、诚实信用的原则。如果一方当事人在签订协议时存在欺诈、胁迫等行为，或者利用对方处于危困状态、缺乏判断能力等情形，致使股权转让协议显失公平，那么受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构撤销该协议。
   • 此外，股权转让协议还需满足形式要件，如书面形式、签字盖章等。如果协议形式不符合要求，也可能影响其合法性。

3. 股权转让的合法性审查：

   • 在股权转让过程中，还需对转让方是否具有合法的股东身份、转让的股权是否属于其合法所有、是否存在股权权属纠纷等进行审查。如果转让方不具备合法的股东身份或转让的股权存在权属纠纷，那么股权转让协议可能因主体不适格或标的物不合法而无效。
   • 同时，还需审查股权转让是否违反了公司章程、股东协议或相关法律法规对股权转让的限制性规定。如果违反了这些规定，股权转让协议也可能面临被撤销或无效的风险。

法律建议：

• 对于合同一方当事人违反规定经商办企业签订的股权转让协议，建议首先审查违反的规定是否属于国家法律法规的强制性规定。如果是，则股权转让协议可能因违法而无效；如果不是，则需进一步审查协议签订过程、股权转让的合法性等方面。
• 在签订股权转让协议前，建议对转让方的股东身份、股权权属、公司章程、股东协议等进行全面审查，确保股权转让的合法性和有效性。
• 如果对股权转让协议的合法性存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师，以便根据具体情况制定合适的法律策略。

可能法律后果：

• 如果股权转让协议因违法或违反公司章程、股东协议等而被认定无效或被撤销，那么转让方和受让方可能需承担返还财产、赔偿损失等民事责任。
• 在某些情况下，如果违反规定经商办企业的行为构成犯罪，如非法经营罪等，那么相关责任人还可能面临刑事责任。

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