股权转让合同协议双方签字后，在符合法定条件的情况下具有法律效力。以下是对这一问题的详细分析：
一、股权转让合同生效的基本条件
行为人具有相应的民事行为能力：
- 合同双方（转让方和受让方）必须都是具有完全民事行为能力的自然人、法人或其他组织。对于自然人，需年满18周岁且精神正常；对于法人，则需依法设立并处于合法存续状态，拥有签订合同的相应权利和行为能力。若一方为无民事行为能力人，其签订的股权转让合同通常无效。
意思表示真实：
- 双方在签订股权转让合同时，其表达的意愿必须是真实、自愿的，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。例如，转让方不得故意隐瞒目标公司的重要信息以误导受让方，受让方也不得在被强迫的情况下签订合同。这是确保合同内容反映双方真实意图的关键。
合同内容合法且不违背公序良俗：
- 股权转让合同的内容和目的必须合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不能损害社会公共利益和善良风俗。例如，股权转让不能用于逃避债务或进行非法的资本运作。
签订程序合规：
- 股权转让合同应采用书面形式，并明确约定股权转让的相关事项，包括转让价格、付款方式、股权交付等。双方需在合同上签字盖章，以确保合同的正式性和可追溯性。此外，对于有限责任公司，股权转让还需遵循公司章程及法定通知义务等相关流程，如股东向股东以外的人转让股权时，通常需要经过其他股东过半数的同意。
二、特殊情况下的效力问题
涉及国有股权或外资企业的股权转让：
- 这类股权转让通常需要经过相关部门的审批，如国有资产监督管理部门、商务主管部门等。未经审批，股权转让合同虽成立但不生效。因此，在签订此类合同时，务必确保已履行相关审批程序。
代理人签订股权转让合同：
- 若代理人获得了股东的合法授权，并且授权书中明确规定了包括代为签订股权转让合同在内的代理权限，同时代理人在授权的具体范围和期限内与受让方签订了协议，则该协议有效。但若代理人未获得授权或超越了授权范围，则协议效力可能处于待定状态，需被代理的股东追认后才生效。
三、法律后果与风险提示
有效合同的法律后果：
- 如果股权转让合同满足上述所有条件，那么它就是合法有效的，对双方具有法律约束力。双方应按照合同约定履行各自的义务，如有任一方违约，对方可依据法律维护自身权益，包括要求违约方承担赔偿责任等。
无效或可撤销合同的法律后果：
- 在某些特殊情况下，如存在恶意串通损害第三方利益、合同内容违法或违反公序良俗等，股权转让合同可能被认定无效或可撤销。此时，双方需承担相应的法律责任，并可能面临经济损失。
四、建议与总结
签订合同前的审查：
- 在签订股权转让合同前，双方应仔细审查合同内容，确保意思表示真实、内容合法且不违背公序良俗。同时，应了解并遵守相关法律法规和程序要求，如公司章程的规定、审批程序的履行等。
寻求专业法律帮助：
- 股权转让涉及复杂的法律问题和程序要求，建议双方在签订合同前咨询专业律师，以确保合同的合法有效性和双方权益的最大保护。
综上所述，股权转让合同协议双方签字后，在符合法定条件的情况下具有法律效力。但双方在签订合同时应谨慎审查合同条款和程序要求，以确保合同的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。