如果司机发生交通事故且自己全责，公司通常无权直接起诉司机修车。下面我来详细解释一下这个问题：

首先，我们要明确交通事故的责任归属。在这起事故中，司机被认定为全责，这意味着司机需要对事故造成的损失承担赔偿责任。然而，这种赔偿责任主要是针对事故中的受害方，比如对方车辆、行人或者公共设施的损失。

接下来，我们来看公司和司机之间的关系。司机作为公司的员工，在驾驶公司车辆时发生交通事故，虽然可能会给公司带来一定的损失（比如车辆损坏需要修理），但这种损失通常是通过公司内部的管理制度或者劳动合同来解决的，而不是通过法律诉讼的方式。

公司可以依据内部的管理制度或者劳动合同的约定，要求司机承担一定的赔偿责任，比如支付部分或者全部的修车费用。但这属于公司内部的管理行为，不是法律诉讼。如果司机不同意承担这些费用，公司可以通过内部争议解决机制来处理，比如调解、仲裁或者依据劳动合同的约定解除与司机的劳动关系等。

另外，值得注意的是，如果司机在驾驶公司车辆时发生交通事故是因为执行工作任务而造成的，那么根据《民法典》的相关规定，用人单位（即公司）可能需要承担一定的侵权责任。但这种情况下，公司也是通过法律途径向事故的受害方承担赔偿责任，而不是向司机提起诉讼要求修车。

综上所述，在司机发生交通事故且自己全责的情况下，公司通常无权直接起诉司机修车。公司可以通过内部管理制度或者劳动合同的约定来处理与司机之间的赔偿问题。如果司机对公司的处理决定有异议，可以通过法律途径来维护自己的合法权益。