违法行为已过追究时效终止调查，并不意味着认定了违法行为。下面我来详细解释这一点：

在刑事案件处理过程中，如果违法行为已过追究时效，公安机关会依据《公安机关办理刑事案件程序规定》与《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，终止对案件的侦查。这是因为，法律规定的追诉时效期限是司法机关追究犯罪分子刑事责任的有效期限，超过这个期限，司法机关将不再追究其刑事责任。

具体来说，“违法行为已过追究时效终止调查”这一决定，是基于法律对追诉时效的规定，而不是对违法行为本身的认定。它仅仅表明，由于时间的流逝，法律不再允许对该违法行为进行刑事追究，但并不意味着该行为在法律上被认定为合法或无罪。

因此，如果你或他人面临这样的情况，应该理解这是法律程序的一个正常环节，而不是对行为性质的最终判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。