合同纠纷与代理合同纠纷并非同一案由，也不构成重复起诉。下面我将对此进行详细分析：

一. 合同纠纷与代理合同纠纷的区别

1. 合同纠纷：这是指因合同的生效、解释、履行、变更、终止等行为而引起的合同当事人之间的所有争议。它是一个广泛的范畴，涵盖了各种类型的合同，如买卖合同、租赁合同、借款合同等。

2. 代理合同纠纷：这是指因代理合同而产生的争议。代理合同是代理人以被代理人的名义，在代理权限内与第三人实施民事行为，其法律后果直接由被代理人承受的协议。因此，代理合同纠纷特指与这种特定类型的合同相关的争议。

• 例如，甲与乙签订了一份货物买卖合同（合同纠纷），而丙作为甲的代理人与乙进行交易（代理合同纠纷）。如果乙因货物质量问题起诉甲，这是合同纠纷；如果乙因丙的代理行为不当而起诉，则是代理合同纠纷。两者虽然都涉及合同，但争议的重点和性质完全不同。

二. 不构成重复起诉

根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第二百四十七条，重复起诉需要满足以下条件：后诉与前诉的当事人相同、诉讼标的相同、诉讼请求相同，或者后诉的诉讼请求实质上否定前诉裁判结果。由于合同纠纷与代理合同纠纷的诉讼标的（即争议的法律关系）不同，因此它们不构成重复起诉。

综上所述，合同纠纷与代理合同纠纷是两种不同的案由，它们之间不存在包含关系，也不构成重复起诉。在处理这类案件时，法院会根据具体的合同类型和争议焦点来确定案由，并据此进行审理和判决。如有进一步需要，您可以继续咨询我。