关于公司负责运营的股东违反合作协议约定，能否主张退股及违约金的问题，我的回答如下：

首先，结论是可以主张退股及违约金，但具体需根据合作协议的具体条款以及相关法律法规来判断。

1. 退股的可能性：

   • 股东退股通常受到公司章程、股东协议以及《公司法》等相关法律法规的约束。
   • 如果合作协议中明确规定了股东在违反协议时可以退股，或者公司章程、股东协议中有相应的退股条款，并且这些条款不违反法律法规的强制性规定，那么股东就有权主张退股。
   • 如果没有明确的退股条款，但股东的行为严重损害了公司利益或其他股东权益，且无法通过其他途径解决，也可能通过法律途径寻求退股。

2. 违约金的主张：

   • 合作协议中如果明确规定了违约金条款，即当一方违反协议时，需要向守约方支付违约金，那么守约方就有权主张违约金。
   • 违约金的数额通常会在协议中明确约定，或者约定一个计算方式。如果协议中没有明确约定，则需要根据违约行为给公司造成的实际损失以及相关法律法规来确定违约金的数额。

3. 法律建议：

   • 在主张退股及违约金之前，建议先仔细审查合作协议、公司章程以及相关法律法规，确保自己的主张有充分的法律依据。
   • 如果合作协议或公司章程中没有明确的相关规定，或者规定不够明确，建议咨询专业律师，以便更准确地了解自己的权益和可能的法律后果。
   • 在与违约股东协商或采取法律行动之前，建议收集好相关证据，如合作协议、公司章程、股东会决议、财务记录等，以便在必要时提供证明。

综上所述，公司负责运营的股东违反合作协议约定时，可以根据合作协议的具体条款以及相关法律法规来主张退股及违约金。但具体能否成功主张，以及主张的数额和方式，都需要根据具体情况来判断。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请随时向我咨询。