关于合作期未满股东退出时，退出股东的股份是否需要退还的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况来综合判断。以下是从不同角度进行的分析：
一、公司章程或股东协议的约定
有明确约定：
- 如果公司章程或股东协议中明确规定了合作期未满时股东退出的股份处理方式，比如需要退还股份、股份转让给其他股东或第三方、或者由公司回购等，那么应当按照这些约定来执行。
- 示例：假设公司章程规定，合作期未满时，退出股东需将其股份以原价转让给其他股东。在此情况下，退出股东的股份就需要按照章程规定进行转让。
无明确约定：
- 如果公司章程或股东协议中没有明确规定合作期未满时股东退出的股份处理方式，那么就需要依据《公司法》等相关法律法规来处理。
二、《公司法》的相关规定
股份转让：
- 根据《公司法》的规定，股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。
- 应用：在合作期未满时，如果股东希望退出，可以尝试与其他股东协商转让其股份。如果其他股东同意，则可以按照协商的价格和条件进行转让。
公司回购：
- 在某些特定情况下，如公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利，并且符合本法规定的分配利润条件；或者公司合并、分立、转让主要财产等，对股东会该项决议投反对票的股东可以请求公司按照合理的价格收购其股权。
- 注意：但这种情况并不直接适用于合作期未满股东主动退出的情况，除非能证明公司行为符合上述特定条件之一。
解散清算（极端情况）：
- 如果公司经营发生严重困难，继续存续会使股东利益受到重大损失，且通过其他途径不能解决的，持有公司全部股东表决权百分之十以上的股东，可以请求人民法院解散公司。
- 说明：这通常是在公司无法继续经营或股东之间矛盾无法调和时的极端措施，并不直接涉及合作期未满股东退出的问题。
三、实际操作中的建议
协商解决：
- 在合作期未满时，股东退出最好通过协商的方式解决。可以与其他股东或公司管理层进行沟通，寻求一个双方都能接受的解决方案。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，或者对股份处理方式存在争议，可以寻求专业的法律援助。律师可以根据具体情况提供法律意见，并帮助制定解决方案。
完善公司章程和股东协议：
- 为了避免未来出现类似的争议，建议在制定公司章程和股东协议时，就明确规定合作期未满时股东退出的股份处理方式。这样可以为未来的合作提供明确的法律保障。
综上所述，合作期未满股东退出时，其股份是否需要退还取决于公司章程或股东协议的约定以及《公司法》的相关规定。在实际操作中，最好通过协商的方式解决争议，并寻求专业的法律援助以确保解决方案的合法性和有效性。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。