不能直接从工资里扣违约金。下面我来详细解释一下这个问题：
首先，我们要明确一点，违约金是合同双方约定的一方违约时应当支付给另一方的款项。而工资是劳动者提供劳动后，用人单位应当支付给劳动者的报酬。这两者性质不同，不能混为一谈。
现在，你提到的情况是在合同期限内（两个月）只工作了一个月就想离职，并询问违约金是否可以从工资中扣除。对此，我们需要从以下几个方面进行分析：
合同约定：首先要看合同中是否有关于违约金的约定，以及违约金的支付方式和条件。如果合同中明确规定了违约金的支付方式和条件，并且没有规定可以直接从工资中扣除，那么就不能擅自从工资中扣除违约金。
法律规定：根据《中华人民共和国劳动法》和相关法律法规的规定，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。因此，即使合同中有关于违约金的约定，也不能违反法律规定直接从工资中扣除。
实际操作：如果确实存在违约情况，并且合同中约定了违约金，那么应当按照合同约定的方式支付违约金。如果合同没有约定或者约定不明确，双方可以协商解决。但无论如何，都不能直接从工资中扣除违约金。
综上所述，违约金不能直接从工资中扣除。如果你面临这样的情况，建议与用人单位进行协商，明确违约金的支付方式和条件，避免产生不必要的纠纷。如果有任何法律问题或者需要进一步的帮助，请随时向我咨询。