当员工自动离职时，HR需要按照一系列流程来办理相关手续，以确保离职过程的合规性和后续工作的顺利进行。以下是需要办理的主要手续及步骤：

一、确认离职事实

首先，HR需要与离职员工或其直接上级确认离职事实，包括离职日期、离职原因等，并记录在案。这有助于后续办理退工手续和社保转出等事宜。

二、办理退工手续

退工手续是员工离职后必须办理的重要环节。HR需要按照公司规定和当地劳动法规的要求，为员工办理退工手续。具体步骤可能包括：

1. 填写退工表：根据公司提供的退工表模板，填写员工的个人信息、离职日期、离职原因等。

2. 提交退工申请：将填好的退工表提交给相关部门或负责人审核，并按照规定流程办理退工手续。在一些地区，如上海，HR可以通过“一网通办”平台或“上海市人力资源和社会保障自助经办系统”在线办理退工和停止缴费登记。

3. 办理社保转出：在办理退工手续的同时，HR还需要为员工办理社保转出手续。这通常包括停止缴纳社保费用、办理社保关系转移等。在上海地区，社保转出和退工手续可以同步办理。

4. 更新员工档案：将离职员工的档案进行更新，记录离职时间、原因等信息，并妥善保存。

三、结算薪资与福利

根据公司的薪资结算制度和劳动法规的要求，HR需要为员工结算离职前的薪资和福利，包括未休年假、加班费、奖金等。确保薪资结算的准确性和及时性，避免产生纠纷。

四、办理其他相关手续

除了上述主要手续外，HR还可能需要为员工办理其他相关手续，如公积金转出、工作交接等。这些手续的具体办理方式和要求可能因地区和公司而异，HR需要根据实际情况进行办理。

五、注意事项

在办理员工自动离职手续时，HR需要注意以下几点：

1. 合规性：确保所有手续都符合当地劳动法规和公司规定的要求，避免产生法律风险。

2. 及时性：尽快办理相关手续，确保员工的权益得到保障，同时避免影响公司的正常运营。

3. 沟通与记录：与员工保持良好的沟通，及时解答疑问，并记录整个离职过程的重要信息，以备后续查询。

综上所述，员工自动离职时，HR需要按照一系列流程办理退工手续、结算薪资与福利等，并确保所有手续的合规性和及时性。通过妥善办理这些手续，可以保障员工的权益，同时维护公司的正常运营和声誉。