针对您提出的“入室盗窃3900元后主动投案自首并且退赃，取得被害人谅解，该怎么量刑”的问题，以下是我的专业分析：
结论前置：入室盗窃3900元后主动投案自首并退赃，且取得被害人谅解，法院在量刑时会综合考虑这些因素，从轻处罚。但具体量刑需由法院根据案件具体情况决定。
分析说明：
盗窃罪的定罪与量刑：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百六十四条的规定，盗窃公私财物，数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金。入室盗窃属于盗窃罪的一种情形，且盗窃数额3900元已达到“数额较大”的标准。
自首的情节：
- 主动投案自首是法定的从轻或者减轻处罚的情节。根据法律规定，犯罪嫌疑人自动投案，如实供述自己的罪行的，是自首。对于自首的犯罪分子，可以从轻或者减轻处罚。
退赃与取得被害人谅解：
- 退赃是积极弥补被害人损失的行为，可以在一定程度上减轻犯罪的危害后果。取得被害人谅解也是量刑时考虑的一个重要因素，它反映了犯罪嫌疑人悔罪态度和社会危害性的降低。
综合量刑：
- 法院在量刑时会综合考虑盗窃的数额、手段、情节以及自首、退赃、取得被害人谅解等因素。虽然自首、退赃和取得被害人谅解可以从轻处罚，但具体量刑还需根据案件的具体情况，如犯罪嫌疑人的前科情况、社会危险性等进行综合评估。
总结：
入室盗窃3900元后主动投案自首并退赃，且取得被害人谅解，这些情节在量刑时都会被法院考虑。虽然无法给出具体的量刑结果，但可以肯定的是，这些积极因素将有助于减轻犯罪嫌疑人的刑事责任。如果您或您的亲友面临类似情况，建议尽早咨询专业律师，以便更好地了解法律程序和量刑标准。