与公司员工签订薪酬协议后不执行公司现行的薪酬制度是不合法的。具体分析如下：

1. 薪酬协议的法律效力：

   • 薪酬协议是公司与员工之间就薪酬问题达成的书面约定，一旦签订，即具有法律效力。
   • 双方都应严格按照协议内容履行，任何一方违反协议都可能构成违约。

2. 公司现行薪酬制度的地位：

   • 公司现行的薪酬制度是公司内部关于薪酬管理的规定，通常会在员工入职时或签订劳动合同时告知员工。
   • 薪酬制度是公司管理的一部分，但它不能替代或凌驾于薪酬协议之上。

3. 不执行薪酬协议的法律后果：

   • 如果公司不执行与员工签订的薪酬协议，而单方面按照公司现行的薪酬制度支付薪酬，这实际上是对薪酬协议的违反。
   • 员工有权要求公司按照协议约定的薪酬标准支付薪酬，并可能通过法律途径维护自己的权益。

4. 建议：

   • 公司在与员工签订薪酬协议时，应确保协议内容与公司现行的薪酬制度相一致，或明确说明协议与制度之间的关系。
   • 如果公司需要调整薪酬制度，应及时与员工沟通并协商修改薪酬协议，以确保双方的权益得到保障。

综上所述，与公司员工签订薪酬协议后不执行公司现行的薪酬制度是不合法的，公司应严格按照薪酬协议的约定履行支付薪酬的义务。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。