医院扣了工资又扣奖金是否违法，取决于扣减的原因和依据。作为合同工，你与医院之间建立了劳动关系，医院对你的工资和奖金的扣减必须遵循相关法律法规和劳动合同的约定。
合法扣减：
- 如果医院扣减工资和奖金是基于合法的理由，如你违反了医院的规章制度、未完成工作任务、或者因你的过错给医院造成了损失等，并且这些扣减在劳动合同中有明确的约定或者符合法律法规的规定，那么这种扣减是合法的。
- 另外，如果医院因经营困难或者调整薪酬结构等原因需要扣减员工工资和奖金，但事先与你进行了协商，并且扣减后的工资不低于当地最低工资标准，那么这种扣减也是合法的。
违法扣减：
- 如果医院扣减工资和奖金没有合法的理由，或者扣减的数额、方式等违反了劳动合同或者法律法规的规定，那么这种扣减就是违法的。
- 例如，医院不能无故克扣员工工资和奖金，也不能以不合理的理由（如性别、种族、宗教信仰等）进行扣减。
如果你认为医院对你的工资和奖金扣减存在违法情况，你可以首先与医院进行沟通协商，要求医院给出合理的解释和依据。如果协商无果，你可以向当地劳动监察部门投诉举报，或者通过法律途径维护自己的合法权益。
总之，医院扣了工资又扣奖金是否违法，需要具体分析扣减的原因和依据。如果你对此有疑问或者需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。