法院认为检察院对被告人职务犯罪调查不全面时，可以建议检察院补充侦查，也可以自行调查取证。具体分析如下：

一. 建议检察院补充侦查

1. 法律依据：根据《刑事诉讼法》第一百七十五条第三款规定：“对于补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉的决定”。这表明，如果法院认为检察院的调查不全面，可以建议检察院进行补充侦查，以完善证据链。
2. 实践操作：在法院审理过程中，如果发现检察院对被告人职务犯罪的调查存在遗漏或不足，法院可以向检察院提出补充侦查的建议。检察院在接到建议后，应当进行进一步的调查，以补充和完善证据。

二. 法院自行调查取证

1. 法律依据：根据《刑事诉讼法》第一百九十七条：“法庭审理过程中，当事人和辩护人、诉讼代理人有权申请通知新的证人到庭，调取新的物证，申请重新鉴定或者勘验”。同时，法院在审判过程中也有权自行调查取证，以确保案件的公正审理。
2. 实践操作：如果法院认为检察院的调查不全面，且检察院未能及时补充侦查或补充侦查后仍然证据不足，法院可以依职权自行调查取证。这包括调取新的证据、询问证人、鉴定或勘验等，以查明案件事实。

我的观点：法院在审理职务犯罪案件时，如果发现检察院的调查不全面，应当积极采取措施，确保案件的公正审理。这既可以通过建议检察院补充侦查来实现，也可以在必要时由法院自行调查取证。无论采取何种方式，都应确保证据的充分性和合法性，以维护司法公正和被告人的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。