当您在试用期提出辞职并已经超过了三天，但公司仍然不让您离开时，您可以按照以下步骤来维护自己的合法权益：

一、再次书面提出离职申请

1. 明确离职意愿：首先，您需要再次明确地向公司表达您的离职意愿。这次建议以书面形式进行，以确保有明确的记录。
2. 使用EMS邮寄：为了保留证据，建议您使用EMS（邮政特快专递）将离职申请邮寄给公司，并在邮件上注明“离职申请”字样。这样，您就能确保公司收到了您的申请，并且有一个官方的邮寄记录作为证据。

二、向劳动监察部门投诉

1. 了解权益：如果公司仍然阻拦您离职，您可以向当地的劳动监察部门咨询并投诉。劳动监察部门是负责监督企业遵守劳动法律法规的机构，他们有权责令公司改正不当行为。
2. 提交证据：在向劳动监察部门投诉时，请提供您的离职申请、EMS邮寄记录以及其他相关证据，以便他们能够更全面地了解您的情况。

三、申请劳动仲裁

1. 准备材料：如果劳动监察部门的介入未能解决问题，您可以考虑直接申请劳动仲裁。在申请劳动仲裁之前，请确保您已经收集了所有相关的证据，包括合同、离职申请、邮寄记录以及与公司的沟通记录等。
2. 提交申请：携带相关证据和申请材料，前往当地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。在申请中，您需要明确请求确认劳动关系的解除以及要求公司办理离职手续。
3. 等待裁决：提交申请后，劳动争议仲裁委员会将对您的案件进行审理，并作出裁决。如果公司不配合执行裁决结果，您还可以依法向人民法院申请强制执行。

四、法律依据

根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。因此，公司在您提出离职并已经超过了三天后仍然阻拦您离职的行为是违法的。您有权依法维护自己的离职权益，并要求公司办理离职手续。

五、注意事项

1. 保持冷静：在处理此类问题时，请保持冷静和理性，避免与公司发生不必要的争执。
2. 保留证据：在整个过程中，请务必保留好所有相关的证据和记录，以便在需要时提供证明。
3. 及时咨询：如果您对法律程序或自己的权益有任何疑问，建议及时咨询专业的法律人士或劳动监察部门。

总之，当您在试用期提出辞职并已经超过了三天但公司仍然不让您离开时，您可以通过再次书面提出离职申请、向劳动监察部门投诉以及申请劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。