停工留薪期只发基本工资是不合法的。员工在停工留薪期间应享受与原来相同的工资待遇，不能仅发放基本工资。

详细分析如下：

根据《工伤保险条例》第三十三条的明确规定，职工因工作原因遭受事故伤害或患职业病，并需要暂停工作以接受工伤医疗时，其所在单位应在停工留薪期内按月支付与原工资福利待遇相等的薪资。这里的“原工资福利待遇”是一个综合性的概念，它不仅包括了职工的基本工资，还涵盖了奖金、津贴、补贴等各项福利，即职工在正常出勤状态下所能获得的全部收入。

1. 工资福利待遇的涵盖范围：

   • 停工留薪期间，职工应享受的工资福利待遇包括基本工资、奖金、津贴、补贴等所有正常工资范畴内的收入，以确保其生活水平不受影响。

2. 停工留薪期的时长与延长：

   • 停工留薪期一般不超过12个月。对于伤情严重或情况特殊的工伤职工，经过设区的市级劳动能力鉴定委员会的确认，可以适当延长，但延长时间同样不得超过12个月。

3. 工伤职工的权益保护：

   • 如果公司在停工留薪期内仅支付了基本工资，而未支付其他应得的福利待遇，工伤职工有权要求公司补足与其原工资相等的福利待遇。
   • 若公司拒绝支付，工伤职工可以通过与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。

综上所述，停工留薪期只发基本工资是违反《工伤保险条例》规定的。工伤职工应了解自己的合法权益，并在必要时采取适当措施来维护这些权益。如果你在这方面遇到了问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。