结论：停工留薪期间只发基本工资，在多数情况下是不合法的。员工应享受与原来相同的工资待遇，不能仅发放基本工资。

详细分析：

1. 法律规定：

   • 根据《工伤保险条例》第三十三条的明确规定，当职工因工作原因遭受事故伤害或患职业病，并需要暂停工作以接受工伤医疗时，其所在单位应在停工留薪期内按月支付与原工资福利待遇相等的薪资。这里的“原工资福利待遇”是一个综合性的概念，它不仅包括了职工的基本工资，还涵盖了奖金、津贴、补贴等各项福利，即职工在正常出勤状态下所能获得的全部收入。

2. 工资构成与支付：

   • 如果员工的工资结构仅仅包含基本工资，那么在停工留薪期间，单位只需支付这部分基本工资即可视为合法。然而，在实际工作中，大多数员工的工资构成往往更加复杂，除了基本工资外，还包括了各种形式的津贴、奖金等额外收入。在这种情况下，单位若仅支付基本工资而忽略了其他部分的收入，则显然违反了《工伤保险条例》的相关规定。

3. 特殊情况处理：

   • 对于工作未满12个月的员工，虽然具体的工资计算方式可能会因个人情况而有所不同，但同样应遵循“原工资福利待遇不变”的原则进行妥善处理。这意味着，即使员工工作时间较短，单位也应根据其实际工资构成来支付停工留薪期间的工资。

4. 维权途径：

   • 如果用人单位未能按照这一标准支付工资，员工首先可以尝试与单位进行沟通协商，要求其按照规定支付全额工资。若协商无果，员工有权向当地的劳动监察部门进行投诉，或者通过劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。

建议：

• 了解自身权益：员工应了解自己在停工留薪期间的合法权益，包括应享受的工资待遇和福利待遇。
• 保留证据：在工伤发生后，员工应保留好与工资、工伤相关的证据，如工资条、工伤认定书等，以便在需要时证明自己的权益。
• 积极维权：如果发现用人单位存在违法行为，员工应积极采取措施维护自身权益，包括与单位协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等。

可能后果：

• 如果用人单位在停工留薪期间仅支付基本工资而未支付其他应得的福利待遇，员工有权要求用人单位补足差额工资，并可能因此获得相应的经济补偿。
• 如果用人单位拒绝支付或未按时支付工资，员工可以通过法律途径维护自己的权益，用人单位可能因此面临法律责任和处罚。

总之，停工留薪期间只发基本工资在大多数情况下是不合法的。员工应确保自己获得与原来相同的工资待遇，并在必要时积极采取措施维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。