休息扣底薪是否合法，需根据具体情况来判断。以下是对不同情形下的详细分析：

1. 因公司原因放假：

   • 若公司因自身原因（如订单不足、设备检修等）安排员工放假，且放假时间未超出一个工资支付周期，公司应按劳动合同约定的标准支付员工工资，此时扣底薪是不合法的。
   • 若放假时间超出上述周期，员工未提供正常劳动时，公司应按当地规定支付生活费，标准通常不低于最低工资的一定比例。在此情况下，按规定支付则扣底薪不属于违法；反之，若公司未按规定支付，则扣底薪是违法的。

2. 因员工个人原因请假：

   • 若员工因个人原因（如事假）请假，公司可根据规章制度扣除相应底薪，但需确保规章制度已经过民主程序制定，并向员工公示告知，且扣除标准应合理，不得过度克扣。

3. 法定节假日休息：

   • 法定节假日是劳动者应有的休息时间，用人单位应当依法支付劳动者在法定节假日期间的工资，不得扣除底薪。若用人单位违反规定，在法定节假日扣除劳动者工资，是违法的。

综上所述，休息扣底薪的合法性取决于具体情形。若您面临此类问题，建议首先与公司进行沟通协商，要求说明扣薪原因并提供依据。若协商不成，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。如有需要，您可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助。